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细菌(bacteria)的生物学分类属于原核细胞生物界，广义的细菌概念包括所有原核细胞型生物，有细菌、放线菌、衣原体、支原体、立克次氏体和螺旋体；狭义的细菌的概念专指其中的细菌。它种类繁多，数量庞大， 代表性，一般情况下通常是指狭义概念的细菌。
1．细菌的大小形态细菌是肉眼看不见，需经显镜放大几百倍或一千倍才能看见的小生物。通常以米(μm)为测量单位。由于细菌是透明的，因此，要经过染色，才可以看见它们的轮廓、形态，甚至结构。通常，电镜观察细菌的超结构时用nm（1/1000μm）测量其大小，光镜观察细菌时用μm( 1/1000 mm)测量。当然，不同的细菌，甚至有时同一类细菌也可因菌龄、细菌生长所处的环境因素不同，其大小、形态都有不同或有一定程度的差异。
临床最常用的细菌染色方法是革兰染色法。经过革兰氏染色可将细菌分为两大类：紫色的是革兰氏阳性菌，红色的是革兰氏阴性菌。由于两类细菌的细胞壁结构不同，决定了其染色性不同，且对人体的
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